Megahit : reduce workdir size + check results (functional test : output + expected process)

Reduire la taille du workdir généré par megahit :

• Pour l'etape d'assemblage par megahit, ajouter la suppression du dossier intermedaire intermediate contig

rajouter des tests fonctionnels pour megahit :

• Verification des resultats = rajouter repertoire avec les output attendus avec megahit dans metagwgs-test-datasets
• Rajouter megahit dans expected_processes_sr.tsv